DATA ENGINEER NLP

Détails de l’offre

Poste proposé

DATA ENGINEER NLP

Descriptif

L'ÉTABLISSEMENT :

Le CHU de BREST, établissement support du GHT de Bretagne Occidentale, recherche un(e) Ingénieur(e) d'études hospitalier (Data Engineer) pour un CDD de 6 mois renouvelable.

Etablissement dynamique situé en bord de mer, le CHU de Brest est un acteur économique de 1er plan : 1er opérateur de santé et moteur économique de la région, l'établissement est le 1er employeur de la ville.

Le Centre Hospitalier Universitaire couvre un territoire comprenant une population de 1,2 million d'habitants et emploie plus de 8000 personnes dont 750 médecins. Il offre à la fois des soins de proximité et de recours.

Le CHU de BREST : Qui sommes-nous ?

https://www.brest-life.fr / https://www.toutcommenceenfinistere.com/

LE POSTE :

Suivi technique du projet PARTAGES

• Déploiement et maintien en conditions opérationnelles des composants du noeud local de la plateforme nationale d'évaluation fédérée
• Constitution et préparation des jeux de données locaux servant à l'évaluation : extraction, sélection, contrôle de conformité, documentation
• Exécution des campagnes d'évaluation des modèles fournis par le consortium sur les données réelles de l'établissement
• Production, contrôle et transmission des métriques d'évaluation au coordonnateur du projet
• Documentation du cadre réglementaire et de sécurité appliqué, traçabilité des traitements réalisés
• Interface technique avec les équipes du Health Data Hub et des autres partenaires ; participation aux points d'avancement et contribution aux rendus techniques attendus

Accompagnement du service sur l'analyse textuelle des comptes rendus médicaux

• Exploration et cartographie des bases contenant des documents textuels : volumétrie, typologies de comptes rendus, métadonnées, chaînage aux séjours et aux patients

• Conception, développement et industrialisation des chaînes de traitement (ETL) d'extraction et de préparation des corpus, orchestrées sous Dagster- Mise en qualité des données : détection des anomalies, doublons, documents tronqués ou mal rattachés ; normalisation et documentation des corpus produits

• Définition et calcul des métriques d'évaluation des traitements (qualité des corpus, performance des modèles) et restitution aux équipes métier

• Mise en oeuvre technique des cas d'usage prioritaires retenus par le service, en s'appuyant sur les ressources ouvertes produites par PARTAGES (corpus PARHAF et PARCOMED, modèles open source) :

• Génération de comptes rendus fictifs (data augmentation)

• pseudonymisation automatique des comptes rendus médicaux

• Aide au codage médical automatisé à partir des comptes rendus (DIM)

• Utilisation, spécialisation et évaluation de modèles de langage sur les corpus annotés, sur l'infrastructure de calcul dédiée

• Documentation des travaux (code, jeux de données, résultats), versionnement sous Git et transfert de compétences auprès de l'équipe

PROFIL RECHERCHÉ :

Le poste est à pourvoir rapidement au sein du Centre de Données Cliniques de l'Hôpital Morvan.

Le poste est ouvert aux profils juniors, y compris aux candidats en première expérience professionnelle.

Conditions d'emploi

CDD de 6 mois renouvelable

Temps de travail : 100 %

Poste à pourvoir rapidement

Rémunération selon l'expérience

Profil recherché

Vous êtes titulaire d'un Master 2 ou d'un diplôme d'ingénieur en informatique, science des données, intelligence artificielle ou dans un domaine équivalent.

Une première expérience, y compris académique, dans l'orchestration de flux de données ou le traitement automatique du langage constitue un atout.

Connaissances requises

Anglais scientifique

Biologie

Bureautique / Technologies de l'information et de la communication

Conduite de projet

Éthique et déontologie médicales

Informatique / Systèmes d'information

Méthodes de recherche clinique

Vocabulaire médical

RÉMUNÉRATION brut : 2500.00 / mois

Personne à contacter

Pour plus de simplicité, postulez en cliquant sur le lien de l'offre ci-après :

[email protected]

Voir l’offre originale et postuler : https://app.beetween.com/WeaselWeb/p/#/apply/job/31mw7snzp14n/data-engineer-nlp

Etablissement

Hôpital Morvan

2 Av Foch

29609 Brest