Guillaume Barreau

Développement et évaluation d'un agent IA utilisant les graphes et appliqué au domaine de la cybersécurité.

Conception et implémentation de data workflows et d'APIs pour des projets de valorisation de données d'observation de la terre (EODT4Crises, SeaScope)

Développement d’un système permettant de mettre en œuvre un plan tactique d'urgence en générant des consignes de positionnement pour chaque véhicule de gendarmerie mobilisable.

Recherche de gènes impliqués dans la résistance aux bioagresseurs chez les espèces sauvages de tomate et de melon. Implémentation d’un pipeline d’analyse de données de séquençage à haut débit basé sur le Bulk Segregant Analysis (QTL-seq). Comparaison de différentes stratégies pour l'assemblage du génome du melon (360Mb) à partir de données hétérogènes de séquençage (Pacbio, ONT, 10xGenomics) et de cartographie optique (Bionano).

• Consultation sur les stratégies de recherche en génomique et leur déclinaison en process de bio-informatique. • Mise en place d'un entrepôt de données génomiques pour le département de recherche et une instance de galaxy pour la création de workflow de traitements de données. • Formation sur l'outil et maintenance. Rédaction de rapports de veille technologique. • Supervision de projets de séquençage complets de souches bactériennes propriétaires. • Recherche de gènes d’intérêts dans les génomes.

Responsabilité technique du développement d’une plateforme permettant aux avocats de gérer seuls des actions en justice regroupant plusieurs milliers de plaignants. • Recrutement et mentoring d’une équipe de développement agile. • Formalisation du besoin, des règles d'affaire et des workflows • Architecture SOA autour de Django avec passerelles vers ZenDesk, PayZen et OwnCloud, • Formalisation du besoin, des règles d'affaire et des workflows, La plateforme permet : • de gérer les interactions avec les clients (communication, paiements, faturation, dépôt de pièces, …), • aux avocats de travailler collaborativement sur les dossiers clients, • de générer automatiquement les documents nécessaires à la procédure collective. Livraison du système à temps pour une action de 4000 plaignants contre le laboratoire Merck (Lévothyrox).

Dans le cadre d'un programme de recherche en urbanisme, j'ai été mandaté pour développer un logiciel permettant de simuler l’impact de perturbations sur le réseau routier sur certains indicateurs globaux d'accès à l'emploi. Ont été développé un simulateur pour le back-end et un front-end permettant de saisir les paramètres de la simulation via la sélection de points sur une carte géographique. Les résultats étaient fournis sous forme de fichier par email. • Élaboration itérative avec le client des solutions front-end et back-end • Adaptation du calculateur open-source OpenTripPlanner pour minimiser le développement, • Développement du back-end en Java et du front-end à base de carte (Leaflet et jQuery) Ce travail a servi de base à la publication: "Project-level accessibility analysis for land-use planning by Jonathan Levine, Louis Merlin and Joe Grengs, Transport Policy, Volume 53, 2017, Pages 107-119"

• En concertation avec les chercheurs et les directeurs opérationnels des différentes plateformes (génotypage, séquençage, protéomique), j'ai assuré la planification et la définition des évolutions logicielles de la plateforme de bio-informatique. • Introduction de la méthodologie Scrum pour le développement générant une augmentation de la qualité du développement et de la satisfaction au sein de l’équipe. • Accompagnement de 2 équipes de développement comme Scrum Master. • Développement de pipelines et d'algorithmes spécialisés dans le domaine de la génomique.